ワイヤー矯正と比較すると、痛みは少ない傾向にあります。インビザラインでは、歯の移動量がシミュレーションによって細かくコントロールされており、無理のない力で歯を動かしていきます。さらに、マウスピース型の装置のため、歯同士が強くぶつかることが少なく、違和感も抑えられます。
また、ワイヤーのように粘膜に当たることがないため、口内炎などのお口のトラブルも起こりにくいです。ただし、新しいマウスピースに交換した直後は、軽い締め付け感や違和感を覚えることがありますが、多くの場合は2日〜3日程度で慣れていきます。